Polski
PGD ONE FM™
Diagnostyka chorób rzadkich w kierunku najczęściej występujących mutacji
Diagnostyka chorób rzadkich w kierunku najczęściej występujących mutacji
Co to jest PGT-M najczęstsze mutacje?
PGD ONE FM™ to badanie pozwalające na wykrycie najczęściej występujących wad genetycznych (mutacji) dziedziczonych przez potomstwo od rodziców. Analizie poddawany jest materiał DNA zarodków jeszcze przed przeniesieniem ich do macicy czyli zanim kobieta zajdzie w ciążę.
Badanie może być wykonane z materiału pobranego w drodze biopsji w 5/6 dobie hodowli zarodka (biopsja komórek trofoktodermy). Ze względu na ryzyko błędnego rozpoznania spowodowanego zanieczyszczeniem plemników w przypadku użycia standardowego zapłodnienia in vitro, rekomenduje się zastosowanie procedury ICSI. Każda diagnostyka PGT-M najczęstsze mutacje (PGD ONE FM™) traktowana jest indywidualnie i poprzedzona badaniem materiału od przyszłych rodziców. W ramach procedury wymagany jest transfer mrożonych zarodków (FET)
Oferta dotyczy badania w kierunku wszystkich zmian (mutacji) w sekwencji nukleotydowej typu:
- substytucje jednonukleotydowe
- delecje do 20 nukleotydów
- insercje do 20 nukleotydów
Pierwsze na świecie wykorzystanie
NGS (Next Generation Sequencing)
w diagnostyce preimplantacyjnej PGD ONE™
w kierunku chorób jednogenowych.
Laboratorium Genetyczne INVICTA: luty 2015 r.
Zgodnie z aktualną bazą HGMD (The Human Gene Mutation Database) - w ramach PGT-M najczęstsze mutacje możemy wykonać diagnostykę w kierunku prawie 90% wszystkich znanych mutacji:
170.118
Liczba znanych mutacji wg bazy HGMD
152.085
Mutacje możliwe do zdiagnozowania w ramach programu PGD ONE FM (90% znanych mutacji wg bazy HGMD)
Dlaczego warto wykonać badanie zarodka PGT-M (PGD ONE FM™)?
- Możliwość zdiagnozowania na etapie zarodka każdej choroby jednogenowej o znanym podłożu genetycznym i ograniczenie ryzyka jej wystąpienia u potomstwa
- Możliwość jednoczesnego wykonania badania PGT-A (PGS-NGS 360°™) z jednej próbki (jednej biopsji) – ograniczenie ryzyka wystąpienia choroby jednogenowej (najczęściej występujących mutacji) oraz wad genetycznych wynikających z nieprawidłowej liczby chromosomów
Przykłady możliwych do zdiagnozowania mutacji w ramach diagnostyki PGT-M najczęstsze mutacje
| Gen | Nazwa mutacji | Typ mutacji | Wielkość mutacji | Jednostka chorobowa (nazwa angielska) [OMIM ID] | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Tradycyjna | wg. HGVS | Białkowa | ||||
| CFTR | F508del | c.1521_1523delCTT | p.Phe508del | delecja | 3 | Mukowiscydoza (Cystic Fibrosis) [219700] |
| R117H | c.350G>A | p.Arg117His | substytucja | 1 | ||
| 3600+2insT | c.3468+2dupT | - | duplikacja | 1 | ||
| 1717-1G>A | c.1585-1G>A | - | substytucja | 1 | ||
| R347P | c.1040G>C | p.Arg347Pro | substytucja | 1 | ||
| 2184delA | c.2052delA | p.Lys684Asnfs*38 | delecja | 1 | ||
| 2184insA | c.2052_2053insA | p.Gln685Thrfs*4 | insercja | 1 | ||
| DHCR7 | 452G>A | c.452G>A | p.Trp151* | substytucja | 1 | Zespół Smitha, Lemlego i Opitza (Smith-Lemli-Opitz syndrome) [270400]) |
| - | c.1054C>T | p.Arg352Trp | substytucja | 1 | ||
| GJB2 | 35delG | c.35delG | p.Gly12Valfs*2 | delecja | 1 | Głuchota wrodzona (Deafness) [220290] |
| IVS1+1G>A | c.-23+1G>A | - | substytucja | 1 | ||
| NBN | 657del5 | c.657_661delACAAA | p.Lys219Asnfs*16 | delecja | 5 | Zespół Nijmegen (Nijmegen breakage syndrome) [251260] |
| TSC1 | 2332delAT | c.2111_2112delAT | p.Tyr704* | delecja | 2 | Stwardnienie guzowate (Tuberous sclerosis complex) [191100] |
| WAS | c.325_334del10bp | c.325_334del10 | p.Ser108fs*16 | delecja | 10 | Zespół Wiskotta-Aldricha (Wiskott-Aldrich syndrome) [301000] |
| APC | - | c3807_c.3808delAT | p.lle1269Met*fs6 | delecja | 2 | Zespół gruczolakowatej polipowatości rodzinnej (Familial Adenomatous Polyposis, FAP) [175100] |
| KRT14 | - | c.374G>A | p.Arg125His | substytucja | 1 | Pęcherzowe oddzielanie się naskórka (Epidermolysis bullosa simplex, EB) |
| PMM2 | - | c.385G>A | p.Val129Met | substytucja | 1 | Zaburzenia glikozylacji białek CDG typu 1A (Congenital disorder of glycosylation type Ia) [212065] |
| COL1A1 | - | c.2155G>T | p.Gly719Cys | substytucja | 1 | Wrodzona łamliwość kości (Osteogenesis imperfecta, OI) [166200] |
| ASL | - | c.337C>T | p.Arg113Trp | substytucja | 1 | Argininobursztynuria (Argininosuccini caciduria, AS) [207900] |
| PROP1 | c.301delAG | c.301_302delAG | p.Leu102Cysfs*8 | delecja | 2 | Wielohormonalna niedoczynność przysadki, WNP (Pituitary hormone deficiency, combined, 2; CPHD2) [262600] |
| SCO2 | G1541A | c.418G>A | p.Glu140Lys | substytucja | 1 | Encefalopatia mitochondrialna (Cardioencephalomyopathy, fatal infatile, due to cytochrome c oxidase deficiency 1) [604377] |
| ADSL | - | c.1277G>A | p.Arg426His | substytucja | 1 | Deficyt liazy bursztynianowej (Adenylosuccinate lyase deficiency) [608222] |
| - | c.1082G>T | p.Gly361Val | substytucja | 1 | ||
| CPS1 | - | c.3697G>C | p.Ala1231Pro | substytucja | 1 | Noworodkowa hiperamonemia typu 1(Carbamoylphosphate synthetase I deficiency) [237300] |
| IVS16-8A>G | c.1836-8A>G | - | substytucja | 1 | ||
| NBS1 | 657del5 | c.657_661delACAAA | p.Lys219Asnfs*16 | delecja | 5 | Zespół Nijmegen (Nijmegen breakage syndrome, NBS) [251260] |
| LDLR | - | c.935_936delAG | p.Glu312Valfs*19 | delecja | 2 | Hipercholesterolemia rodzinna (Hypercholesterolemia, familial) [143890] |
| F8 | - | c.530_540del10 | p.Tyr177Cysfs*18 | delecja | 10 | Hemofilia A (Hemophilia A; HEMA) [306700] |
| DMD | - | c.5131C>T | p.Gln1711* | substytucja | 1 | Dystrofia mięśniowa Duchene'a (Duchenne muscular dystrophy) [310200] |
| - | c.6554dupT | p.Leu2185Phefs*38 | duplikacja | 1 | ||
| HBB | - | c.20A>T | p.Glu7Val | substytucja | 1 | Anemia sierpowata (Sickle cell anemia) [603903] |
| HBB | - | c.27dupG | p.Ser10Valfs*14 | duplikacja | 1 | Talasemia (Thalassaemia beta) [613985] |
Wskazania do wykonania PGT-M (PGD ONE FM™)
- Osoby z wynikiem badania genetycznego potwierdzającym kliniczne rozpoznanie choroby jednogenowej
- Osoby z wynikiem badania genetycznego potwierdzającym obecność nosicielstwa mutacji (najczęściej występujących mutacji)
- Występowanie dziedziczonych chorób genetycznych lub stwierdzenie obciążenia określoną mutacją w rodzinie
Laboratorium Genetyczne INVICTA zapewnia:
- Specjalistyczny Zestaw Pobraniowy PGD BIOPSY KIT™
- Bezpłatny transport
- Dostęp do wyników online
Ograniczenia
PGT-M(PGD ONE FM™)jest spersonalizowaną propozycją diagnostyki preimplantacyjnej skierowaną do szczególnej grupy pacjentów. Jej celem jest wyeliminowanie u potomstwa takiej cechy genetycznej, która w wyniku laboratoryjnej diagnostyki genetycznej została uznana za przyczynę choroby. Wykonanie PGT-M(PGD ONE FM™) nie wyklucza ryzyka wad genetycznych, które mogą być spowodowane innymi niż badane czynnikami, t.j. spontaniczne lub niezdiagnozowane mutacje, inne choroby genetyczne.
Literatura
- 1. Lukaszuk K, Kalwak K, Pukszta S, Liss J, Jakiel G, Woclawek-Potocka I, Galvao A, Wasniewski T. Preimplantation genetic diagnosis of human leukocyte antigen for X-linked immunoproliferative syndrome caused by SAP mutation.
- 2. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 2014 Nov;182:252-3. doi: 10.1016/j. ejogrb.2014.09.034. Epub 2014 Sep 28.
- 3. Treff NR, Fedick A, Tao X, [et.al.]. Evaluation of targeted next-generation sequencing-based preimplantation genetic diagnosis of monogenic disease. Fertil Steril. 2013, 99(5),1377-1384.
- 4.Corrales I, Catarino S, Ayats J, Arteta D, Altisent C, Parra R, et al. High-throughput molecular diagnosis of von Willebrand disease by next generation sequencing methods. Haematologica 2012;97:1003.
- 5. Rechitsky S, Pakhalchuk T, San Ramos G, Goodman A, Zlatopolsky Z, Kuliev A.First systematic experience of preimplantation genetic diagnosis for single-gene disorders, and/or preimplantation human leukocyte antigen typing, combined with 24-chromosome aneuploidy testing. Fertil Steril. 2015 Feb;103(2):503-12. doi: 10.1016/j.fertnstert.2014.11.007. Epub 2014 Dec 13.
- 6. Berger VK, Baker VL. Preimplantation diagnosis for single gene disorders. Semen Reprod Med. 2014 Mar;32(2):107-13. doi: 10.1055/s-0033-1363552. Epub 2014 Feb 10.
- 7. Daina G, Ramos L, Obradors A, Rius M, Martinez-Pasarell O, Polo A, Del Rey J, Obradors J, Benet J, Navarro J. First successful double-factor PGD for Lynch syndrome: monogenic analysis and comprehensive aneuploidy screening. Clin Genet. 2013 Jul;84(1):70-3. doi: 10.1111/cge.12025. Epub 2012 Oct 17.
- 8. Chang LJ, Chen SU, Tsai YY, Hung CC, Fang MY, Su YN, Yang YS. An update of preimplantation genetic diagnosis in gene diseases, chromosomal translocation, and aneuploidy screening. Clin Exp Reprod Med. 2011 Sep;38(3):126-34. doi: 10.5653/cerm.2011.38.3.126. Epub 2011 Sep 30.
- 9. Harper JC, Wilton L, Traeger-Synodinos J, Goossens V, Moutou C, SenGupta SB, Pehlivan Budak T, Renwick P, De Rycke M, Geraedts JP, Harton G. The ESHRE PGD Consortium: 10 years of data collection. Hum Reprod Update. 2012 May- Jun;18(3):234-47. doi: 10.1093/humupd/dmr052. Epub 2012 Feb 16. Review.
- 10. Field PD, Martin NJ. CFTR mutation screening in an assisted reproductive clinic. Aust N Z J Obstet Gynaecol. 2011 Dec;51(6):536-9. doi: 10.1111/j.1479- 828X.2011.01348.x. Epub 2011 Aug 22.
- 11. Preimplantation genetic diagnosis: state of the art 2011. Harper JC, Sengupta SB. Hum Genet. 2012 Feb;131(2):175-86. doi: 10.1007/s00439-011-1056-z. Epub 2011 Jul 12. Review.
- 12. Peyvandi F, Garagiola I, Mortarino M.Prenatal diagnosis and preimplantation genetic diagnosis: novel technologies and state of the art of PGD in different regions of the world. Haemophilia. 2011 Jul;17 Suppl 1:14-7. doi: 10.1111/j.1365- 2516.2011.02559.x
- 13. Simpson JL. Preimplantation genetic diagnosis at 20 years. Prenat Diagn. 2010 Jul;30(7):682-95. doi: 10.1002/pd.2552. Review.
- 14. Basille C, Frydman R, El Aly A, Hesters L, Fanchin R, Tachdjian G, Steffann J, LeLorc’h M, Achour-Frydman N. Preimplantation genetic diagnosis: state of the art. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 2009 Jul;145(1):9-13. doi: 10.1016/j. ejogrb.2009.04.004. Epub 2009 May 2.
- 15. Gutiérrez-Mateo C, Sánchez-García JF, Fischer J, Tormasi S, Cohen J, Munné S, Wells D. Preimplantation genetic diagnosis of single-gene disorders: experience with more than 200 cycles conducted by a reference laboratory in the United States. Fertil Steril. 2009 Nov;92(5):1544-56. doi: 10.1016/j.fertnstert.2008.08.111. Epub 2008 Oct 19.